动物科学系现有畜牧兽医、水产养殖技术、农产品加工与质量检测3个专业，在校生数量常年保持在1000人以上，就业率均保持在90%以上。其中畜牧兽医专业为国家级重点专业，全国首批现代学徒制试点专业，也是学院具有悠久历史的品牌特色专业。目前建有动物养殖实训基地、动物繁育、饲料分析检测中心等13个校内实训室和2个校内生产性实训基地，畜牧兽医专业实训基地于2012年被中央财政确立为职业教育重点支持建设的实训基地；建有省牦牛繁育推广中心、省藏羊繁育推广中心等30多个校外实习基地，其中合作的青海牧源科技股份有限公司于2016年获得“全国高校实践育人创新创业基地”荣誉称号。

动物科学系曾获“全国教育先进集体”、“省级教学团队”等荣誉称号，动物科学系党支部曾获“青海省高校基层党组织示范点”荣誉称号；动物科学系具备一支素质精良、专兼合理的教师队伍，现有专兼职教师34人，“双师型”教师达到70%以上，具有硕士及研究生以上学历15人，占比超过44%，副高以上职称14人，有农业职业教育教学名师1名、省级骨干教师3名、青海省“135”高层次人才培养工程“拔尖学科带头人”和“创新教学科研骨干”2名，校外兼职教师40人；由专业教师发起的“青海湟源牧校—鹰娘支队”创新服务团队荣获2020年全国终身学习品牌项目，申报组建2个科技特派员工作站；人才培养模式改革荣获青海省教学成果奖二等奖1项、三等奖1项、农业部特等奖1项、全国农业职业教育教学成果一等奖1项、行业指导委员会教育教学成果8项；累计建成国家级精品课程1门、国家级精品资源共享课程1门、省级精品课程4门，主参编各类教材42本，累计发表论文100余篇，学生在全国创新创业大赛获奖8项。